En el siglo XIX, las enfermedades infecciosas como la tuberculosis, el cólera, la difteria o las infecciones por heridas eran la principal causa de muerte en todo el mundo. El médico Robert Koch (1843-1910) descubrió que estas enfermedades estaban causadas por bacterias. Junto con sus compañeros de Berlín, identificó los agentes infecciosos y las vías de infección, allanando el camino para las terapias y las medidas preventivas.

En 1891, Koch se convirtió en director del recién fundado Real Instituto Prusiano de Enfermedades Infecciosas, actual Instituto Robert Koch (RKI). En 1905 recibió el Premio Nobel de Medicina por el descubrimiento de los bacilos de la tuberculosis. Junto con Louis Pasteur, Robert Koch es considerado un pionero de la microbiología.

Desde 1910 hay una exposición en el RKI. Se creó tras la muerte de Koch, presentó exclusivamente piezas del patrimonio científico del fundador del instituto y sólo sufrió ligeras modificaciones durante décadas.

En 2017, el museo fue rediseñado y ampliado en colaboración con el Museo de Historia Natural de Berlín: las exposiciones históricas se exhiben en 180 metros cuadrados, al tiempo que se tematiza el contexto de trabajo actual. Se aprende cómo ha cambiado la imagen científica de la salud y la enfermedad y qué papel siguen desempeñando las ideas de Koch y sus alumnos. El mausoleo de Robert Koch también es accesible.

Actualmente, el museo sólo puede ser visitado por grupos con cita previa.