Le musée présente des œuvres exceptionnelles de l'art moderne classique dans le bâtiment Stüler situé à l'ouest, en face du château de Charlottenburg. Sous le titre "Picasso et son temps", des peintures, des sculptures et des travaux sur papier sont exposés sur trois étages. Avec plus de 100 pièces, l'œuvre de Picasso est au cœur de la collection. Toutes les facettes de sa création sont exposées : d'une feuille datant de ses années d'études en 1897 à des œuvres de 1972, réalisées un an avant la mort de l'artiste. La période rose et la période bleue sont également représentées, tout comme les phases du cubisme et du classicisme. Depuis les années 1920, différentes caractéristiques stylistiques s'unissent dans les œuvres.

Le deuxième point fort de la collection est constitué par plus de 60 tableaux de Paul Klee. Petits formats et fragiles, ils dessinent l'univers poétique du peintre de 1917 à 1940. Henri Matisse est représenté par plus de 20 œuvres, dont plus d'une demi-douzaine de ses célèbres silhouettes. Des ensembles plastiques d'Alberto Giacometti ainsi que des exemples de sculptures africaines complètent le noyau de la collection. Depuis l'ouverture de la maison en 1996, Heinz Berggruen n'a cessé d'acheter des œuvres supplémentaires. En 2000, 165 œuvres au total ont été cédées à la Fondation du patrimoine culturel prussien. Après le décès de Heinz Berggruen en 2007, sa famille s'est déclarée prête à prêter d'autres œuvres acquises par Heinz Berggruen et à continuer à compléter la collection par ses propres acquisitions.

L'agrandissement du musée Berggruen par l'ajout de la Kommandantenhaus voisine sur la Spandauer Damm et d'un jardin de sculptures a permis de créer l'espace nécessaire à cet effet en 2013. Le bureau d'architectes Kuehn Malvezzi a créé un couloir en verre qui relie depuis les deux bâtiments historiques.

En raison d'une rénovation de fond, l'établissement est temporairement fermé depuis le 5 septembre 2022. Pendant la période de fermeture, les œuvres seront exposées dans d'autres sites de la Nationalgalerie et en tournée à l'étranger.