Le Neues Museum (Nouveau Musée), construit entre 1843 et 1855, est considéré comme un document exceptionnel de la construction de musées au 19e siècle. Comme l'Altes Museum n'offrait déjà plus assez de place peu après son ouverture, Friedrich August Stüler reçut la commande pour la construction du musée qui fut inauguré en 1859.

L'aménagement intérieur des trois étages d'exposition, comme les célèbres fresques de Kaulbach dans la cage d'escalier, a été réalisé par les plus grands peintres du classicisme tardif berlinois.
Les bombardements de 1943 et 1945 ont fortement endommagé le musée. Ce n'est qu'en 1985 que la reconstruction des ruines de la guerre a commencé avec une sécurisation d'urgence et un assainissement des fondations.

En 1997, l'architecte britannique David Chipperfield a été chargé de la reconstruction. Les séquences spatiales et les volumes perdus ont été recréés sans imiter fidèlement le modèle historique. La restauration de la façade et des espaces intérieurs respecte les traces historiques du monument.

Après plus de 60 ans, les collections du Ägyptisches Museum et du Museum für Vor- und Frühgeschichte sont à nouveau réunies dans leur lieu historique d'origine.