La seconda guerra mondiale in Europa finì l'8 maggio 1945 con la resa incondizionata nella grande sala del museo, un'ex mensa degli ufficiali della scuola dei pionieri della Wehrmacht. Dal 1945 al 1949, l'edificio servì come sede dell'amministrazione militare sovietica in Germania. Nel 1967, il museo sovietico della resa è stato aperto qui. Dopo gli accordi sul ritiro delle forze sovietiche dalla Germania, la Repubblica Federale di Germania e l'Unione Sovietica hanno deciso nel 1990 di costruire congiuntamente un museo in questo sito per commemorare la guerra di sterminio del Reich tedesco contro l'Unione Sovietica dal 1941 al 1945. È stato aperto nel 1995.

Dal 2013, la mostra permanente documenta la guerra dal punto di vista degli attori tedeschi e sovietici. I territori occupati dalla Wehrmacht non furono solo quelli in cui iniziò l'assassinio degli ebrei europei. La guerra e l'occupazione tedesca includevano anche altri crimini come la morte di massa dei prigionieri di guerra sovietici o la fame pianificata di milioni di civili. La mostra affronta anche le conseguenze della seconda guerra mondiale che arrivano fino al presente.

Il museo organizza anche mostre speciali, discussioni, serie di film, conferenze accademiche e gli eventi annuali dell'8 maggio.