Nel XIX secolo, le malattie infettive come la tubercolosi, il colera, la difterite o le infezioni delle ferite erano la principale causa di morte nel mondo. Il medico Robert Koch (1843-1910) scoprì che queste malattie erano causate da batteri. Insieme ai suoi compagni a Berlino, ha identificato gli agenti infettivi e le vie di infezione, aprendo la strada a terapie e misure preventive.

Nel 1891 Koch divenne direttore del neonato Istituto Reale Prussiano per le malattie infettive, ora l'Istituto Robert Koch (RKI). Nel 1905, ricevette il premio Nobel per la medicina per la scoperta dei bacilli della tubercolosi. Insieme a Louis Pasteur, Robert Koch è considerato un pioniere della microbiologia.

C'è una mostra al RKI dal 1910. È stato istituito dopo la morte di Koch, ha presentato esclusivamente pezzi del patrimonio scientifico del fondatore dell'istituto ed è stato solo leggermente modificato per decenni.

Nel 2017, il museo è stato ridisegnato e ampliato in collaborazione con il Museo di Storia Naturale di Berlino: i reperti storici sono esposti su 180 metri quadrati, mentre allo stesso tempo viene tematizzato il contesto lavorativo attuale. Si impara come è cambiata l'immagine scientifica della salute e della malattia e quale ruolo giocano ancora le idee di Koch e dei suoi studenti. Anche il mausoleo di Robert Koch è accessibile.

Attualmente il museo può essere visitato solo da gruppi su appuntamento.