W XIX wieku choroby zakaźne, takie jak gruźlica, cholera, błonica czy zakażenia ran były główną przyczyną zgonów na całym świecie. Lekarz Robert Koch (1843-1910) odkrył, że choroby te wywoływane są przez bakterie. Wraz ze swoimi towarzyszami z Berlina zidentyfikował czynniki zakaźne i drogi zakażenia, torując drogę terapiom i środkom zapobiegawczym.

W 1891 r. Koch został dyrektorem nowo założonego Królewskiego Pruskiego Instytutu Chorób Zakaźnych, obecnie Instytutu Roberta Kocha (RKI). W 1905 roku otrzymał Nagrodę Nobla w dziedzinie medycyny za odkrycie pałeczek gruźlicy. Robert Koch, obok Ludwika Pasteura, jest uważany za pioniera mikrobiologii.

Wystawa w RKI jest organizowana od 1910 roku. Powstała ona po śmierci Kocha, prezentowała wyłącznie dzieła z naukowego majątku założyciela instytutu i przez dziesięciolecia była tylko nieznacznie zmieniana.

W 2017 roku muzeum zostało przeprojektowane i rozbudowane we współpracy z berlińskim Muzeum Historii Naturalnej: na 180 metrach kwadratowych prezentowane są historyczne eksponaty, a jednocześnie tematyzowany jest współczesny kontekst pracy. Dowiadujemy się, jak zmienił się naukowy obraz zdrowia i choroby oraz jaką rolę nadal odgrywają idee Kocha i jego uczniów. Dostępne jest również mauzoleum Roberta Kocha.

Obecnie muzeum może być zwiedzane tylko przez grupy po wcześniejszym umówieniu.